医学杂志从出版周期上可分为周刊、旬刊、半月刊、月刊、双月刊、季刊、年刊等；从使用文字上可分为中文期刊、英文期刊、法文期刊等，从出版或编辑机构上可分为学术团体出版的期刊、政府机构出版的期刊、出版社或厂商出版的期刊；从载体形态以及文献加工程度上分为一次文献、二次文献、三次文献等。
医学杂志按内容又可分为：
①学术、技术性杂志，主要收集科研、医疗、教学等方面的学术论文、研究报告、实验报告、临床报告等原始文献。信息量大，情报价值高，是医学期刊的核心部分，如学报、纪年、会刊或会议录、汇刊、综述、进展、年鉴等。
②快报性杂志，专门收集有关最新科研成果的论文，预报将要发表的论文摘要。内容简洁，报道速度快。如各种快报、快讯等。西文快报性刊物常常带有通讯、短讯、通报等字样。
③消息性杂志，一般收集与学术机构或厂商企业有关的新闻消息，作为与社会（或机构的成员）之间保持联系的纽带，刊名中常带有新闻或快讯等字样。
④资料性杂志，主要收集实验数据、统计资料和技术规范等方面的内容，专门向用户报道各种数据和事实性情报，刊名中常带有数据、记事录等字样。
⑤检索性杂志，供查找文献用，常带有文摘索引等字样。
⑥译文、译报，介绍国外医学研究的刊物。
⑦科普性杂志，主要以读者群为标准来划分的杂志，旨在普及医药卫生知识。
所谓核心期刊是指信息密度大、数量多、质量好、时效长的重点期刊。医学杂志的确定取决以下几个条件：①杂志内容的被摘率；②杂志内容的被引率；③杂志在流通中的借阅和利用率。世界卫生组织于1979年公布世界200种西文医学杂志，包括英国的《柳叶刀》和美国的《新英格兰医学杂志》等著名杂志。
医学杂志属于自然科学的一类，核心期刊世界公认标准为SCI期刊，国内医学杂志以CSCD中国科学引文数据库（分为核心库（C）和扩展库(E)）；北大中文核心期刊和科技核心期刊（统计源期刊），其中职称评定基本参照北大中文核心期刊和科技核心期刊。
