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口腔科学论文

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原代人口腔角质细胞在产黑普氏菌作用后的转录组分

来源:搜集整理   日期:2022-06-20 08:47:49点击数:

摘    要:目的 探究产黑普氏菌(Prevotella melaninogenica,P.m)作用下原代人口腔角质细胞(primary human oral keratinocytes,pHOK)的转录组变化,并在人口腔角质形成细胞(human oral keratinocyte,HOK)细胞系中进行验证。方法 分离培养pHOK,并与P.m共培养4 h与24 h,提取总RNA,构建基因文库,转录组测序,分析差异表达基因,并进行基因本体论(gene ontology,GO)通路分析与京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析,在HOK与P.m共培养模型中采用qRT-PCR及Western Blot对差异基因进行验证。结果 在pHOK与P.m共培养4 h组与对照组间上调表达的差异基因有:淋巴细胞胞浆蛋白1(lymphocyte cytosolic protein 1,LCP1)、角蛋白7(keratin 7,KRT7)、纤毛和鞭毛相关蛋白251(cilia and flagella associated protein 251,CFAP251)等,下调表达的差异基因有:含FERM、RhoGEF和Pleckstrin结构域蛋白1(FERM, ARH/RhoGEF and Pleckstrin domain protein 1,FARP1)、WW结构域转录调控因子1(WW domain containing transcription regulator 1,WWTR1)、含Discoidin、CUB和LCCL结构域蛋白2(Discoidin, CUB and LCCL domaincontaining protein 2,DCBLD2)等,共1 788个差异表达基因;24 h组与对照组间上调表达的差异基因有:LCP1、补体C1s(complement C1s,C1S)、犬尿氨酸酶(kynureninase,KYNU)等,下调表达的差异基因有:磷酸丝氨酸转氨酶-1(phosphoserine aminotransferase 1,PSAT1)、FARP1、FKBP型脯氨酰异构酶10(FKBP prolyl isomerase 10,FKBP10)等,共1 832个差异表达基因;其中共同差异表达基因(common differentially expressed genes,cDEGs)有LCP1、KYNU、长链非编码RNA958(long intergenic non-protein coding RNA 958,LINC00958)等1 090个,差异均具有统计学意义。通过GO数据库分析,cDEGs主要富集到细菌对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应、细胞的顶端部分等;通过KEGG分析,cDEGs富集到的通路有白介素-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、Toll样受体通路等;从cDEGs中筛选肌球蛋白1B(myosin1B,MYO1B)在HOK与P.m共培养模型中进行验证,qRT-PCR及Western Blot检测结果表明,MYO1B的表达在对照组和P.m刺激组之间存在显著性差异(P<0.001),且其表达随P.m刺激时间的延长及刺激浓度的增大而递增。结论 P.m对口腔角质细胞的转录组存在重要影响。
 
关键词:口腔扁平菩藓;产黑普氏菌;转录组测序;肌球蛋白1B;上皮屏障功能;白介素-17信号通路,肿瘤坏死因子信号通路; TolI样受体通路;细胞顶
端部分;
 
Transcriptome analysis of primary human oral keratinocytes stimulated with Prevotella
melaninogenica
GUO Yiting HAN Wenhao XU Pan SHAO Ruru HE Yuan .
School of Stomatology, Tongji University Department of Gastroenterology, Shanghai 10th People's
Hospital & School of Life Sciences and Technology, Tongji University
 
 
Abstract:
Objective To investigate the transcriptomic changes in primary human oral keratinocytes(pHOKs) after coculture with Prevotella melaninogenica(P.m) and to verify the changes in human oral keratinocyte(HOK) cell lines. Methods pHOK was isolated and cocultured with P.m for 0, 4 and 24 h. Total RNA was extracted, a gene library was constructed, transcriptional sequencing was performed, differentially expressed genes(DEGs) were analyzed,gene ontology(GO) pathway analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG) pathway analysis were performed, and the validation of DEGs was performed by qRT-PCR and Western Blot in the HOK and P.m coculture cell model. Results 1 788 DEGs were detected between the 4 h group and control group, including upregulated DEGs such as lymphocyte cytosolic protein 1(LCP1), keratin 7(KRT7) and Cilia and flagella associated protein 251(CFAP251)and downregulated DEGs such as FERM, ARH/RhoGEF and Pleckstrin domain protein 1(FARP1), WW domain containing transcription regulator 1(WWTR1) and Discoidin, CUB and LCCL domain-containing protein 2(DCBLD2).1 832 DEGs were detected between the 24 h group and control group, including upregulated DEGs such as LCP1, complement C1s(C1S), kynureninase(KYNU) and downregulated DEGs such as phosphoserine aminotransferase 1(PSAT1),FARP1 and FKBP prolyl isomerase 10(FKBP10). There were 1 090 common differentially expressed genes(cDEGs) in the 4 h and 24 h groups, including LCP1, KYNU and long intergenic nonprotein coding RNA 958(LINC00958). The GO pathways were mainly enriched in response to lipopolysaccharide and the molecules of bacterial origin and apical part of the cell. KEGG pathway analysis revealed enrichment in the interleukin-17(IL-17) signaling pathway, tumor necrosis factor(TNF) signaling pathway, Toll-like receptor(TLR) pathway, etc. We verified the expression of a cDEG, Myosin1B(MYO1B), and qRT-PCR and Western Blot analysis showed that MYO1B expression was significantly upregulated between the control group and the P.m cocultured group(P<0.001), and its expression followed a time-dependent and concentration-dependent manner. Conclusion P.m played an important role in the transcriptome of oral keratinocytes.
 
Keyword:
oral lichen planus; Prevotella melaninogenica; RNA-seq; myosin1B; epithelial barrier function; interleukin-17 signaling pathway; tumor necrosis factor signaling pathway; Toll-like receptor pathway; apical part of cell;
 
口腔扁平苔藓(oral lichen planus,OLP)是口腔黏膜病专科中最常见的疾病之一,最新研究表明整体发病率在0.89%左右[1]。目前OLP发病机制尚不明确,普遍认为OLP是机体内在与外在因素联合作用引发的疾病。在一些外在因素(病原体、药物、牙科材料等)作用下,易感人群口腔黏膜病损部位的上皮细胞与抗原呈递细胞活化,这些细胞分泌多种炎症因子与趋化因子,激活T淋巴细胞,形成持续存在的免疫炎症反应[2]。在OLP患者的唾液、组织及颊黏膜拭子中发现了菌群失调的现象[3,4,5],菌群失调可能在OLP发生发展过程中起到重要作用[6]。本课题组前期研究发现,OLP组颊黏膜表面微生物菌落结构与健康对照组相比发生显著性改变,其中产黑普氏菌(Prevotella melaninogenica,P.m)在OLP组颊黏膜表面构成比显著增加,且该菌能够侵入到OLP病损组织上皮层及固有层,并与巨噬细胞相互作用,提示P.m可能在OLP的发生发展中起到重要作用[5]。而口腔黏膜上皮角质形成细胞作为抵抗外界入侵的第一道屏障,P.m与口腔上皮角质细胞的相互作用并不清楚。
 
转录组测序是对特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和进行高通量测序。通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息。目前,对OLP转录组研究并不完善,多集中于OLP的癌变倾向[7]、OLP的炎症反应过程[8]等。有关口腔共生菌作用下,口腔上皮角质形成细胞转录组的改变目前尚无研究。因此本研究利用转录组测序技术,研究原代人口腔角质形成细胞(primary human oral keratinocytes,p HOKs)在P.m刺激下基因表达的改变,对差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行生物信息学分析,并筛选其中的差异基因进行验证,为探究DEGs所参与的通路与OLP的相关性提供实验基础。
 
1 材料和方法
1.1 主要材料和仪器
人口腔角质形成细胞系(human oral keratinocyte,HOK)由陈谦明教授惠赠[9]。Prevotella melaninogenica ATCC®25845TM(ATCC,美国),OKM培养基(Sciencell,美国),PBS(上海生工,中国),dispase酶(Sigma,美国),DMEM培养基(Hyclone,美国),胎牛血清(WISENT,美国),RNAiso Plus(Ta Ka Ra,中国),无水乙醇(上海生工,中国),氯仿(国药,中国),异丙醇(国药,中国),Prime ScriptTMRT reagentKit Perfect Real Time(Ta Ka Ra,中国),TB Green Premix Ex Taq(Ta Ka Ra,中国),BCA protein assay kit(Solarbio,中国),MYO1B一抗(Santa Cruz,美国),β-Tubulin一抗(Proteintech Biotechnology,中国),辣根过氧化物酶标记羊抗兔Ig G(碧云天,中国),超敏ECL化学发光试剂盒(碧云天,中国),实时荧光定量PCR仪(Thermo Fisher,美国),小型高速离心机(Eppendorf,美国),Bio-Rad电泳系统(Bio-Rad,美国),多功能酶标仪(Bio-Tek,美国)。
 
1.2 样本的收集与处理
1.2.1 p HOKs的分离与培养
本实验获得同济大学附属口腔医院伦理委员会的批准(伦理审批号:2018-002)。组织来源于同济大学附属口腔医院口腔颌面外科智齿拔除术时取下的颊黏膜组织,把组织放到含10%双抗PBS中清洗三遍。随后将组织放到0.25%中性蛋白酶(dispaseⅡ)中4℃过夜。第二天用无菌眼科镊分离组织上皮,PBS清洗2次,0.25%含EDTA的胰酶37℃震荡消化4 min,用含10%FBS的DMEM培养基终止消化,离心,去上清,PBS清洗沉淀2次,用2 m L OKM培养基重悬沉淀并铺板于六孔板,培养于37℃、5%体积分数CO2的细胞培养箱中。
 
1.2.2 HOK细胞培养
HOK细胞以5×105个/m L的细胞密度接种于12孔板中,在添加了10%FBS的DMEM培养基中,37℃、5%体积分数CO2的细胞培养箱中培养,待镜下细胞密度达90%时用于实验。
 
1.2.3 P.m菌株培养与菌液制备
冻存于-80℃的P.m菌液于37℃化冻,均匀涂于基础厌氧血平板,加厌氧袋置于密封袋,置于37℃孵箱复苏;3 d后挑取平板上黑褐色菌点于新鲜液体厌氧培养基中,盖上并旋松管盖,加厌氧袋置于密封袋中,置于37℃摇床。1 d后测菌液OD600=1,以4 000 rpm离心3 min,弃上清,PBS清洗3次后,加1 mL PBS重悬菌液,最终菌液浓度为1×109CFU/mL。
 
1.2.4 菌液与细胞共同培养
(1)菌液与p HOKs共同培养:p HOKs培养到第三代后用于实验,吸去细胞上清液,PBS轻柔洗涤细胞3次,更换为不含血清的DMEM培养基,每孔加入10μL菌液,分别共培养4 h和24 h作为两实验组,以未与菌液共培养的p HOKs作为对照组,处理后的细胞于37℃、5%体积分数CO2的细胞培养箱中分别培养相应时长,随后提取细胞总RNA用于转录组测序。
 
(2)菌液与HOK细胞系共同培养:HOK细胞吸去细胞上清液,PBS轻柔洗涤细胞3次,更换为不含FBS的DMEM培养基。
 
为分别探究P.m对HOK细胞系在时间梯度和浓度梯度共培养后造成的影响,设置时间梯度共培养组和浓度梯度共培养组,以未与菌液共培养的HOK细胞作为对照组。时间梯度组每孔加入10μL菌液,各组共培养体系最终菌液浓度为5×106CFU/m L,分别培养4 h、6 h、8 h;浓度梯度组每孔分别加入10μL、20μL、30μL菌液,各实验组体系中最终菌液浓度分别为:5×106CFU/m L、10×106CFU/m L、15×106CFU/m L,共培养4 h。用DMEM培养基补足液体量,对照组只添加基础DMEM培养基,使各组共培养体系最终液体的量相同,总体积2 m L,以便计算菌液浓度。将处理后的细胞在37℃、5%CO2的细胞培养箱中培养,随后吸去上清,PBS轻柔洗细胞3次,待后续实验。
 
1.3 CCK-8法检测细胞活性
通过CCK-8法检测P.m刺激后HOK细胞的活性。HOK细胞与P.m共培养。共培养完成后,轻柔吸去细胞上清液,PBS轻柔洗涤细胞3次,每孔加入100μL DMEM培养基和10μL CCK-8溶液,避光反应1 h。随后在酶标仪450 nm处测定细胞上清液吸光度,相对细胞活力计算方法:(实验组细胞吸光度/对照组细胞吸光度)×100%。
 
1.4 总RNA的提取
将共培养完成后的细胞吸去上清,PBS轻柔洗涤3次,按试剂盒说明提取总RNA。测定RNA浓度。
 
1.5 转录组测序
将样本送至上海晶能生物科技有限公司完成转录组测序。基本程序为:RNA片段化,逆转录成双链DNA,加工双链DNA末端,PCR扩增。PCR产物热变性形成单链,单链DNA环化得到单链环状DNA文库,DNA文库用Illumina Nova 6000测序平台进行高通量转录组测序,获得高质量的转录组数据。
 
1.6 测序结果的分析
对数据质量评估,对所获得的序列进行基因注释,用HTSeq软件计算各个基因的reads count。使用R语言limma包进行DEGs挑选。取log2(差异倍数)≥1且P≤0.05的基因筛选为具有统计学意义的DEGs。通过R软件的Pheatmap包对DEGs进行聚类分析,用GO数据库对DEGs进行生物学功能注释,用KEGG Pathway数据库对DEGs进行通路的注释。利用R语言富集常用包cluster Profiler(版本3.18.0)对DEGs做GO、KEGG pathway的注释富集分析。对DEGs数量≥2,且统计P≤0.05的注释条目认为具有统计学意义。
 
1.7 q RT-PCR验证差异表达基因
逆转录试剂盒逆转录合成c DNA,再以实时荧光定量试剂盒进行实时荧光定量PCR。以GAPDH为内参。肌球蛋白1B(myosin1B,MYO1B)正义链:5’-GGAGACCATGGCCA AAATGG-3’,MYO1B反义链:5’-GGTCAAAGCGCT TCTTGAGG-3’;GAPDH正义链:5’-GGACCTGACC TGCCGTCTAG-3’,GAP-DH反义链:5’-GTAGCCCA GGATGCCCTTGA-3’。
 
1.8 Western Blot验证差异表达基因
使用含1 mmol/L PMSF的RIPA裂解液提取HOK细胞总蛋白,BCA试剂盒测蛋白浓度。7.5%的SDS-PAGE凝胶电泳分离,转移至PVDF膜,封闭液室温下封闭1 h,一抗孵育,4℃过夜,洗膜后加二抗,室温孵育1 h,增强型化学法显色,Image Quant LAS 4000 mini显影。
 
1.9 统计学分析
应用Graph Pad Prism 8.0对数据进行统计学分析并绘制统计图。多组数据间比较采用单因素方差分析(one-way analysis of variance,ANOVA),以Tukey进行两两比较,P<0.05为差异有统计学意义。
 
2 结果
2.1 P.m对HOK细胞活力的影响
在倒置相差显微镜下可观察到完整的HOK单层细胞(图1a),HOK细胞与P.m共培养后,细胞密度降低,对培养皿底的黏附能力降低;部分细胞形态发生变化,由原本大而扁平的多角形形态转变为扁圆形或圆形,部分细胞的细胞核发生了核固缩,显示出空泡变性和细胞裂解,细胞边界不清晰(图1b,10μL菌液与HOK细胞共培养8 h后镜下图)。
 
对共培养后HOK细胞的细胞活力检测结果(图1c、1d)表明,P.m会降低HOK细胞活力,在时间梯度组中,共培养4 h后细胞活力降低到68.38%±12.30%(P<0.001),共培养6 h后细胞活力降低至38.97%±1.05%(P<0.001),共培养8 h后细胞活力降低至27.44%±0.30%(P<0.001);在浓度梯度组中10μL组细胞活力下降至60.33%±3.93%(P<0.001),20μL组细胞活力下降至44.9%±2.77%(P<0.001),30μL组细胞活力下降至29.02%±2.46%(P<0.001)。
 
2.2 P.m共培养后p HOK细胞差异表达基因及聚类分析
聚类分析结果显示,对照组与实验组的基因簇明显分开,提示对照组和实验组间在整体基因表达上存在明显差异(图2a)。在本次测序所获取的全部基因中,p HOK与P.m共培养4 h组与对照组间有1 788个基因的表达存在统计学差异,共培养24 h组与对照组间有1 832个基因的表达存在统计学差异。
 
p HOK与P.m共培养4 h组相较对照组中表达上调基因为877个,表达下调基因为916个;共培养24 h组相较对照组中表达上调基因为1 012个,表达下调基因为828个,两处理组与对照组间有1 090个共同差异表达基因(common differentially expressed genes,c DEGs)(图2b~2d,表1)。
 
2.3 P.m共培养后p HOK细胞差异表达基因GO富集分析
对各组上调的DEGs和下调的DEGs进行GO富集分析结果显示:(1)对照组与共培养4 h组之间得到的上调DEGs富集于604个生物过程(biological process,BP)条目中,如细胞对脂多糖的反应(cellular response to lipopolysaccharide)、对细菌来源分子的反应(response to molecule of bacterial origin)、生物刺激的细胞反应(cellular response to biotic stimulus)等;富集于12个细胞成分(cellular component,CC)条目中,如细胞顶端部分(apical part of cell)、收缩纤维(contractile fiber)、肌节(sarcomere)等;富集于18个分子功能(molecular function,MF)条目中,如细胞因子活性(cytokine activity)、受体配体活性(receptor ligand activity)、信号受体激活因子活性(signaling receptor activator activity)等(图3a)。
 
(2)对照组与共培养4 h组之间得到的下调DEGs富集于19个生物过程条目中,如上皮发育(epidemis development)、皮肤发育(skin development)、上皮细胞分化调节(regulation of epithelial cell differentiation)等;富集于1个细胞成份条目中,即角质化包膜(cornified envelope)(图3b)。
 
(3)对照组与共培养24 h组之间得到的上调DEGs富集的GO通路与4 h组在分子功能富集条目相似度高(图3c)。
 
(4)对照组与共培养24 h组之间得到的下调DEGs富集于84个生物过程条目中,如化学突触传递的调节(modulation of chemical synaptic transmission)、跨突触信号的调节(regulation of trans-synaptic signaling)、神经递质转运(neurotransmitter transport)等;富集于21个细胞成份条目中,如内质网腔(endoplasmic reticulum lumen)、神经元与神经元突触(neuron to neuron synapse)、突触后密集区(postsynaptic density)等;在MF条目中没有具有统计学差异的富集(图3d)。
 
2.4 P.m共培养后p HOK细胞差异表达基因KEGG通路富集分析
(1)对照组与共培养4 h组之间得到的上调DEGs富集于33条KEGG通路中,显示其与细胞因子与细胞因子受体相互作用(cytokine-cytokine receptor interaction)、病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体相互作用(viral protein interaction with cytokine and cytokine receptor)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路等相关(图4a)。
 
(2)对照组与共培养4 h组之间得到的下调DEGs在KEGG通路数据库中没有得到具有统计学差异的富集条目。
 
(3)对照组与共培养24 h组之间得到的上调DEGs富集于12条KEGG通路中,显示其与白介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路、TNF信号通路、金黄色葡萄球菌感染(Staphylococcus aureus infection)等相关(图4b)。
 
(4)对照组与共培养24 h组之间得到的下调DEGs在KEGG通路数据库中没有得到具有统计学差异的富集条目。
 
2.5 差异表达基因肌球蛋白1B的验证
在本次转录组测序结果中,MYO1B是共培养4 h组、共培养24 h组共有的DEG。
 
将相同浓度(5×106CFU/m L)的P.m与HOK细胞共培养不同时长(0、4 h、6 h、8 h),MYO1B的m RNA表达和蛋白表达在4、6、8 h均显著增加,差异有统计学意义(P<0.005)。
 
将不同浓度的P.m(10μL组、20μL组、30μL组最终菌液浓度分别为:5×106CFU/m L、10×106CFU/m L、15×106CFU/m L)刺激HOK细胞4 h后MYO1B的表达均显著增加,差异有统计学意义(P<0.005)(图5)。
 
3讨论
细菌微生物的菌群失调可能是OLP发生发展的原因之一。本课题组前期发现P.m在OLP患者颊黏膜表面构成比增加最为显著,而口腔上皮角质形成细胞作为口腔黏膜抵御外界入侵的第一道防线,可能直接受P.m刺激影响。在与P.m共培养后,HOK细胞在镜下可保持完整的细胞形态并形成完整的单层细胞,P.m的刺激会降低HOK细胞的活力,对HOK细胞造成损伤;在对OLP患者的口腔角质形成细胞进行体外分离培养后,发现较正常人群相比,OLP患者的口腔角质形成细胞的细胞活力明显降低,细胞形态也发生明显变化[10],本课题组建立的P.m-HOK细胞共培养模型与之相似,推测P.m损伤HOK细胞可能与OLP临床中发生上皮层糜烂和溃疡有关。
 
目前认为免疫失调在OLP发病过程中起到重要作用[11],多个学者报道的OLP组织高通量测序结果[12,13]显示其多富集在与免疫相关的GO与KEGG通路如趋化因子活跃、细胞因子活跃和原发性免疫缺陷等免疫炎症相关通路,以及与上皮发育分化、神经受体配体作用和代谢相关的通路如表皮分化复合体[14]、激活神经元的受体配体交互和酪氨酸代谢[15]等。有文献报道OLP组织中Toll样受体-4(toll like receptor-4,TLR-4)的明显高表达[16],且存在多种细胞因子表达改变,如肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)表达升高[10],白介素-23(interleukin-23,IL-23)和IL-17过表达等[17]。为探究P.m对p HOK短时间作用及较长时间作用的影响,并探究P.m刺激与OLP发生发展之间的关联,本研究进一步将P.m与p HOK共培养后4 h和24 h进行转录组测序,研究结果显示,P.m刺激p HOK细胞后,炎症相关通路如IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、Toll样受体通路、细胞因子与细胞因子受体互作等在两处理组中均明显富集,其他KEGG通路如上皮发育、跨突触信号调节等也有较明显富集,而这些通路与既往报道的OLP转录组测序的富集通路有明显重合。
 
本研究结果显示,P.m与p HOK共培养4 h组GO通路明显富集在细胞顶端部分(apical part of cell)和顶端质膜(apical plasma membrane)这两个细胞成分中。单个上皮细胞之间的空间密封由顶端连接复合物(apical junctional complex)执行,其包含紧密连接、黏附连接和桥粒[18]。细胞黏附建立后,紧密连接通过其蛋白质组分将空间密封起来[19]。本课题组推测,在P.m刺激p HOK细胞早期,p HOK细胞的细胞顶端部分和顶端质膜的顶端连接复合物成分合成加强,以增强细胞间紧密连接,抵抗外界细菌侵入。
 
本研究结果显示,MYO1B是p HOK与P.m共培养4 h、24 h组均上调表达的差异基因。MYO1B即肌球蛋白1B,肌球蛋白是一种以ATP调节的方式结合到肌动蛋白的蛋白质,与肌动蛋白的结合促进肌球蛋白水解ATP,从而为肌动蛋白丝的运动提供动力[20]。肌动-肌球蛋白的收缩是细胞骨架改变的形式之一,肌动蛋白-肌球蛋白环也是组成细胞紧密连接的重要部分,肌动蛋白-肌球蛋白环在维持上皮极性和上皮屏障功能中发挥了重要作用[21]。Lv等[22]报道,肌球蛋白ⅡA(myosin-ⅡA)调控缺氧低糖脑内皮细胞的紧密连接,抑制肌球蛋白ⅡA可减弱claudin-5和ZO-1等紧密连接蛋白的形态变化;Omelchenko等[23]报道,在整体迁移的细胞中,肌球蛋白ⅨA(myosin-ⅨA)的敲除导致肌动蛋白细胞骨架的改变,细胞-细胞间黏附被破坏,导致细胞分散。以上这些实验表明,肌球蛋白家族通过细胞骨架与紧密连接调节了上皮细胞屏障。本研究结果显示,P.m浓度梯度对MYO1B表达的影响更为明显,提示菌群数量的失衡对紧密连接有较大影响。这与本课题组前期研究发现在OLP患者颊黏膜表面菌群失调相印证。此外,文献报道MYO1B参与了舌部鳞状细胞癌等多种肿瘤的发展与转移,且预示了较差的预后以及隐匿性淋巴结转移[24]。提示MYO1B可能参与了OLP恶变。
 
综上,本研究对与P.m共培养4 h和24 h的p HOK细胞进行转录组测序,研究发现P.m和p HOK共培养过程中IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、Toll样受体通路等KEGG通路明显富集,对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应、细胞顶端部分等GO通路明显富集,提示P.m对口腔角质细胞的转录组存在重要影响,其中MYO1B可能在细菌-细胞相互作用中发挥了重要作用。本研究为进一步揭示OLP的发病机制提供了相关的研究基础。
 
【Author contributions】Guo YT performed the experiments and wrote the article.Han WH analyzed the data.Xu P,Shao RR assisted in the experiments.He Y designed the study and reviewed the article.All authors read and approved the final manuscript as submitted.
 
参考文献
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